| area | team | 1st.round | 2nd.round | q.final | semifinal | final | winner | ||||||||||||
| 中国 | ファジアーノ岡山 ネクスト |
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| 1 | レイジェンド 滋賀 |
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| 関西 | レイジェンド滋賀 ＦＣ |
2 | |||||||||||||||||
| 0 | グルージャ 盛岡 |
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| 北海 | トヨタ自動車北海道 | 3 | |||||||||||||||||
| 0 | グルージャ 盛岡 |
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| 東北 | グルージャ盛岡 | 13 | |||||||||||||||||
| 1 | グルージャ 盛岡 |
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| 関東 | ＶＯＮＤＳ市原ＦＣ | 0 | |||||||||||||||||
| 2 | ＶＯＮＤＳ 市原 |
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| 四国 | ＦＣ今治 | 1 | |||||||||||||||||
| 1 | サウルコス 福井 |
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| 北信 | サウルコス福井 | e2 | |||||||||||||||||
| 5 | サウルコス 福井 |
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| 北海 | 札幌蹴球団 | 1 | runner-up | ||||||||||||||||
| 2 | グルージャ 盛岡 |
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| 関東 | ジョイフル本田 つくばＦＣ |
1 | |||||||||||||||||
| 1 | ジョイフル 本田つくば |
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| 九州 | 三菱重工長崎ＳＣ | 0 | |||||||||||||||||
| 3 | ジョイフル 本田つくば |
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| 東海 | 矢崎バレンテＦＣ | 2 | |||||||||||||||||
| 1 | 関大 ２００８ |
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| 関西 | 関大ＦＣ２００８ | 7 | |||||||||||||||||
| 1 | ジョイフル 本田つくば |
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| 関東 | ヴェルフェ たかはら那須 |
0 | |||||||||||||||||
| 0 | ＦＣ大阪 | 地域決勝 | |||||||||||||||||
| 関西 | ＦＣ大阪 | 1 | |||||||||||||||||
| 1 | ＦＣ大阪 | ||||||||||||||||||
| 九州 | FC KAGOSHIMA | 0 | |||||||||||||||||
| 3 | ＦＣ KAGOSHIMA |
winner ! | |||||||||||||||||
| 東海 | 藤枝市役所 | 2 | 3rd place | レノファ山口 ＦＣ |
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| 1 | ＦＣ岐阜 セカンド |
1 | |||||||||||||||||
| 開催 | 時津ＳＣ | 3 | p1 | ||||||||||||||||
| 0 | 浦安ＳＣ | ||||||||||||||||||
| 関東 | 浦安ＳＣ | 10 | 地域決勝 | ||||||||||||||||
| 2 | 浦安ＳＣ | ||||||||||||||||||
| 東海 | トヨタ蹴球団 | 0 | |||||||||||||||||
| 1 | アミティエ ＳＣ |
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| 関西 | アミティエＳＣ | e3 | |||||||||||||||||
| 0 | レノファ山口 | ||||||||||||||||||
| 北信 | ＦＣ北陸 | 1 | |||||||||||||||||
| 1 | 新日鐵住金 大分 |
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| 九州 | 新日鐵住金大分 | 2 | |||||||||||||||||
| 1 | レノファ山口 | ||||||||||||||||||
| 中国 | レノファ山口ＦＣ | 3 | |||||||||||||||||
| 3 | レノファ山口 | ||||||||||||||||||
| 関東 | ｔｏｎａｎ前橋 | 2 | |||||||||||||||||
| 2 | レノファ山口 | ||||||||||||||||||
| 関東 | 千葉教員 | 0 | |||||||||||||||||
| 1 | 千葉教員 | ||||||||||||||||||
| 北信 | 六花亭マルセイズ ＦＣ |
0 | |||||||||||||||||
| 1 | ＦＣ岐阜 セカンド |
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| 東海 | ＦＣ岐阜セカンド | 3 | |||||||||||||||||
| 3 | ＦＣ岐阜 セカンド |
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| 四国 | 高知Ｕトラスター ＦＣ |
0 | |||||||||||||||||
| e3 | ＦＣ岐阜 セカンド |
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| 東北 | ヴァンラーレ八戸 ＦＣ |
2 | |||||||||||||||||
| 1 | ヴァンラーレ 八戸 |
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| 中国 | Dezzolla Shimane |
0 | |||||||||||||||||
| 0 | ヴォルカ 鹿児島 |
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| 九州 | ヴォルカ鹿児島 | e1 | |||||||||||||||||
| e2 | ヴォルカ 鹿児島 |
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| 関西 | バンディオンセ 加古川 |
0 | |||||||||||||||||