| area | team | 1st.round | 2nd.round | q.final | semifinal | final | winner | ||||||||||||
| 北信 | ＡＣ長野パルセイロ | ||||||||||||||||||
| 4 | 長野 パルセイロ |
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| 関東 | クラブ・ドラゴンズ | 0 | |||||||||||||||||
| 2 | 長野 パルセイロ |
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| 東海 | 浜松大学ＦＣ | 0 | |||||||||||||||||
| 0 | 沖縄 かりゆし |
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| 九州 | 沖縄かりゆしＦＣ | 6 | |||||||||||||||||
| 1 | 長野 パルセイロ |
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| 北海 | とかちフェアスカイ ジェネシス |
0 | |||||||||||||||||
| 0 | FCコリア | ||||||||||||||||||
| 関東 | ＦＣコリア | 4 | |||||||||||||||||
| 0 | 九州INAX | ||||||||||||||||||
| 九州 | 九州ＩＮＡＸ | 3 | |||||||||||||||||
| 2 | 九州INAX | ||||||||||||||||||
| 中国 | 佐川急便中国ＳＣ | 0 | |||||||||||||||||
| 1 | 松本山雅 | ||||||||||||||||||
| 関東 | 日立栃木ＵＶＡ | 3 | |||||||||||||||||
| 4 | 日立栃木 UVA |
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| 四国 | 南国高知ＦＣ | 0 | |||||||||||||||||
| 1 | 日立栃木 UVA |
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| 関西 | 三洋電機洲本 | 0 | |||||||||||||||||
| 3 | 三洋電機 洲本 |
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| 北海 | トヨタ自動車北海道 | 1 | |||||||||||||||||
| 1 | 松本山雅 | ||||||||||||||||||
| 関西 | アイン食品 | p1 | |||||||||||||||||
| 2 | FC岐阜 Second |
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| 東海 | ＦＣ岐阜Second | 3 | |||||||||||||||||
| 1 | 松本山雅 | ||||||||||||||||||
| 開催 | 小山田ＦＣ | e2 | |||||||||||||||||
| 0 | 松本山雅 | winner ! | |||||||||||||||||
| 北信 | 松本山雅ＦＣ | 4 | 3rd place | 松本山雅 | |||||||||||||||
| 1 | tonan前橋 | 2 | |||||||||||||||||
| 九州 | ヴォルカ鹿児島 | 2 | 1 | ||||||||||||||||
| 1 | レノファ 山口 |
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| 中国 | レノファ山口 | 2 | 地域決勝 | ||||||||||||||||
| 0 | カマタマーレ 讃岐 |
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| 四国 | カマタマーレ讃岐 | 2 | |||||||||||||||||
| 1 | カマタマーレ 讃岐 |
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| 関西 | バンディオンセ 加古川 |
0 | |||||||||||||||||
| 1 | ツエーゲン 金沢 |
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| 関東 | 海上自衛隊 厚木マーカス |
2 | |||||||||||||||||
| 1 | ツエーゲン 金沢 |
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| 北信 | ツエーゲン金沢 | 4 | |||||||||||||||||
| e1 | ツエーゲン 金沢 |
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| 中国 | 吉備国際工華 | 0 | |||||||||||||||||
| 0 | 札大GP | ||||||||||||||||||
| 北海 | 札大ＧＰ | 2 | runner-up | ||||||||||||||||
| 4 | ツエーゲン 金沢 |
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| 東海 | ＦＣ鈴鹿ランポーレ | 1 | |||||||||||||||||
| 0 | 新日鐵 大分 |
地域決勝 | |||||||||||||||||
| 九州 | 新日鐵大分 | 2 | |||||||||||||||||
| 1 | tonan前橋 | ||||||||||||||||||
| 関西 | BIWAKO S.C. HIRA | p1 | |||||||||||||||||
| 1 | tonan前橋 | ||||||||||||||||||
| 関東 | tonan前橋 | 3 | |||||||||||||||||
| 1 | tonan前橋 | ||||||||||||||||||
| 関東 | 横浜スポーツ＆ カルチャークラブ |
0 | |||||||||||||||||
| 4 | YSCC | ||||||||||||||||||
| 関西 | AS Laranja Kyoto |
3 | |||||||||||||||||
| 1 | YSCC | ||||||||||||||||||
| 東海 | 静岡ＦＣ | 0 | |||||||||||||||||
| 1 | 福島 ユナイテッド |
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| 東北 | 福島ユナイテッド ＦＣ |
2 | |||||||||||||||||