| 01 飛田給メイン | 天皇杯 | 浦和レッズ | 1 - 2 | ガンバ大阪 |
| 31 春野補助 | 四国Ｌ入替 | 昭和クラブ | 0 - 4 | 中村クラブ |
| 07 豊橋臨海 | 天皇杯予選 | 名工大クラブ | 0 - 8 | 東海理化 |
| 07 豊田合成 | 天皇杯予選 | 桜パッシオーネ | 2 - 1 | 名古屋エレファンツ |
| 21 長良川 | ＰＳＭ | FC岐阜 | 0 - 1 | ヴィッセル神戸 |
| 28 新宝緑地 | 天皇杯予選 | 三菱東京UFJ銀行名古屋 | 1 - 0 | 新日鐵住金名古屋 |
| 06 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 4 | 北海道コンサドーレ札幌 |
| 12 埼玉2002メイン | Ｊ１ | 浦和レッズ | 2 - 0 | アビスパ福岡 |
| 13 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 0 | ギラヴァンツ北九州 |
| 19 カシマ | Ｊ１ | 鹿島アントラーズ | 2 - 0 | FC東京 |
| 20 相模原麻溝 | Ｊ３ | SC相模原 | 0 - 1 | YSCC横浜 |
| 26 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 0 | 水戸ホーリーホック |
| 27 名古屋ＷＦＣ | 天皇杯予選 | 守山C.F.C. | 3 - 1 | 高蔵寺FC |
| 03 福島あづま | Ｊ３ | 福島ユナイテッド | 0 - 1 | SC相模原 |
| 09 丸亀 | Ｊ２ | カマタマーレ讃岐 | 3 - 2 | FC岐阜 |
| 10 北条球 | 全社予選 | 麻生FC | 2 - 2 pk | 東レ愛媛 |
| 10 北条陸 | 全社予選 | FDK蹴道 | 2 - 3 | ベンターナAC |
| 23 山口維新 | Ｊ２ | レノファ山口 | 4 - 2 | ジェフ千葉 |
| 23 岡山県営／桃太郎 | Ｊ２ | ファジアーノ岡山 | 0 - 1 | モンテディオ山形 |
| 24 弓浜 | 中国Ｌ | SC鳥取ドリームス | 1 - 2 | デッツォーラ島根 |
| 29 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 2 | レノファ山口 |
| 01 いわき明星大 | 東北Ｌ１ | バンディッツいわき | 2 - 1 | 富士クラブ2003 |
| 03 石川西部緑地 | Ｊ２ | ツエーゲン金沢 | 0 - 1 | 北海道コンサドーレ札幌 |
| 08 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 1 | 清水エスパルス |
| 14 佐野２ | 関西Ｌ２ | FC TIAMO枚方 | 1 - 1 | アイン食品 |
| 14 佐野２ | 関西Ｌ１ | 阪南大クラブ | 2 - 1 | ルネス学園甲賀 |
| 15 高松東部１ | 四国Ｌ | アルヴェリオ高松 | 0 - 3 | KUFC南国 |
| 22 十条朝鮮高 | 関東Ｌ１ | FCコリア | 0 - 2 | VONDS市原 |
| 28 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | モンテディオ山形 |
| 29 軽井沢風越 | 北信越Ｌ１ | アルティスタ東御 | 0 - 0 | サウルコス福井 |
| 04 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 2 - 4 | Ｖファーレン長崎 |
| 05 浜松遠州灘 | 天皇杯予選 | S.B.R. | 0 - 2 | 静岡教員芙蓉クラブ |
| 05 都田 | ＪＦＬ | HondaFC | 1 - 0 | アスルクラロ沼津 |
| 11 松阪サッカー | 東海Ｌ１ | FC伊勢志摩 | 4 - 1 | 常葉大浜松キャンパスFC |
| 12 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | セレッソ大阪 |
| 18 鴨池 | Ｊ３ | 鹿児島ユナイテッド | 0 - 0 | 長野パルセイロ |
| 19 沖縄県総合陸 | Ｊ３ | FC琉球 | 0 - 1 | YSCC横浜 |
| 26 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 2 - 3 | ロアッソ熊本 |
| 02 博多森球技 | Ｊ１ | アビスパ福岡 | 1 - 2 | 浦和レッズ |
| 03 中津ダイハツ九州 | 九州Ｌ | FC中津 | 0 - 2 | テゲバジャーロ宮崎 |
| 09 市立吹田 | Ｊ１ | ガンバ大阪 | 3 - 1 | ベガルタ仙台 |
| 16 盛岡南Ａ | Ｊ３ | グルージャ盛岡 | 1 - 0 | セレッソ大阪U-23 |
| 17 札幌雁来東 | 北海道Ｌ | 札幌北大クラブ | 1 - 5 | 札幌蹴球団 |
| 20 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | ツエーゲン金沢 |
| 23 新居浜１ | 全社予選 | 高知ユナイテッド | 6 - 0 | アルヴェリオ高松 |
| 23 新居浜２ | 全社予選 | 麻生FC | 0 - 8 | KUFC南国 |
| 24 ホンダ細江 | 天皇杯予選 | ボラーレ浜松 | 1 - 4 | 矢崎バレンテ |
| 06 相馬光陽Ｅ | 全社予選 | いわきFC | 9 - 1 | 富士クラブ2003 |
| 06 相馬光陽Ｄ | 全社予選 | 新日鐵住金釜石 | 3 - 2 | バンディッツいわき |
| 06 相馬光陽Ｃ | 全社予選 | コバルトーレ女川 | 9 - 0 | 酒田啄友クラブ |
| 07 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 1 | カマタマーレ讃岐 |
| 14 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 1 | 徳島ヴォルティス |
| 27 長良川メドウ | 天皇杯 | FC岐阜 | 1 - 2 延 | HondaFC |
| 11 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 2 | ジェフ千葉 |
| 18 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 2 - 1 | 愛媛FC |
| 25 田辺陸上 | 関西Ｌ２ | St.Andrew'sFC | 6 - 3 | 岸和田クラブ |
| 02 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 5 | ファジアーノ岡山 |
| 22 愛南あけぼの | 全国社会人 | 富山新庄クラブ | 0 - 1 | アイデンティみらい |
| 22 愛南あけぼの | 全国社会人 | 高知ユナイテッド | 3 - 4 | 三菱水島 |
| 23 宇和島丸山 | 全国社会人 | アイデンティみらい | 1 - 2 | 三菱水島 |
| 03 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 2 - 1 | ザスパクサツ群馬 |
| 05 いずみ野かもめ | 関東社会人 | VONDS市原セカンド | 2 - 1 | 三菱養和SC |
| 06 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 2 - 0 | 横浜FC |
| 12 富山 | 地域／予選 | 三菱水島 | 1 - 0 | コバルトーレ女川 |
| 12 富山 | 地域／予選 | FC刈谷 | 0 - 1 | アルティスタ東御 |
| 13 富山 | 地域／予選 | 三菱水島 | 2 - 1 | アルティスタ東御 |
| 13 富山 | 地域／予選 | FC刈谷 | 1 - 1 pk | コバルトーレ女川 |
| 20 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 4 - 2 | 東京ヴェルディ |
| 26 市原臨海 | 地域／決勝 | ヴィアティン三重 | 0 - 3 | FC今治 |
| 26 市原臨海 | 地域／決勝 | 三菱水島 | 0 - 3 | 鈴鹿アンリミテッド |
| 27 市原臨海 | 地域／決勝 | ヴィアティン三重 | 4 - 1 | 鈴鹿アンリミテッド |
| 27 市原臨海 | 地域／決勝 | 三菱水島 | 0 - 3 | FC今治 |
| 10 長良川 | 東海社会人 | ボンボネーラ岐阜 | 2 - 0 | 伊勢YAMATO |
| 10 長良川 | 東海社会人 | 中京大FC | 3 - 0 | 焼津FC |
| 11 阿久比河村工機 | 全社予選 | 河村工機FC | 5 - 2 | Sois La Polla |
| 11 祖父江の森 | 全社予選 | FC LINK | 3 - 2 | CSCスフィーダ |
| 17 長居球 | 関西ＬＣ | 阪南大クラブ | pk 1 - 1 | ASラランジャ京都 |
| 18 新・蒲郡海陽Ｂ | 全社予選 | ORCA | 1 - 2 | 高浜FC |
| 18 愛知学泉大豊田 | 全社予選 | 名大クラブ | 3 - 2 | 河村工機FC |
| 25 作新学院大 | 天皇杯予選 | 足利SC | 3 - 0 | BAJELVO那須烏山 |
| 25 河内多目的 | 天皇杯予選 | ホンダ栃木 | 0 - 7 | 足利工業大学 |