| 01 国立 | 天皇杯 | サンフレッチェ広島 | 0 - 2 | 鹿島アントラーズ |
| 12 佐賀球技北 | 九州各県 | 耶馬渓クラブ | 5 - 2 | 三宅クラブ |
| 13 佐賀球技南 | 九州各県 | ヴァンクール熊本 | 1 - 0 | 耶馬渓クラブ |
| 27 徳島市陸上 | 四国Ｌ入替 | 徳島コンプリール | 1 - 0 | 東レ愛媛 |
| 03 各務原勤労者 | 岐阜県２昇Ｔ | 江東クラブ | 0 - 6 | FC岐阜セカンド |
| 01 埼玉2002サブ４ | 天皇杯予選 | 北坂戸SC | 1 - 2 | 狭山アゼィリア |
| 08 椹野川Ｂ | 野上杯 | 山口大工学部 | 1 - 1 pk | バレイン下関 |
| 08 椹野川Ａ | 野上杯 | ラツィオ | 1 - 2 | インディゴ山口 |
| 08 椹野川Ｂ | 野上杯 | FC OPA | 0 - 6 | RENOFA YAMAGUCHI |
| 16 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | ベガルタ仙台 |
| 29 長居陸上 | Ｊ２ | セレッソ大阪 | 1 - 0 | FC岐阜 |
| 12 博多森球技 | Ｊ２ | アビスパ福岡 | 1 - 5 | FC岐阜 |
| 13 布勢多目的 | 全社予選 | 元気SC | 2 - 0 | Easeスフィーダ |
| 13 布勢球技 | 全社予選 | ノートリアス | 0 - 4 | 鳥取KFC |
| 19 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 2 - 3 | 横浜FC |
| 26 保土谷サッカー | 関東Ｌ１ | 東邦チタニウム | 0 - 3 | 町田ゼルビア |
| 26 平塚 | Ｊ２ | 湘南ベルマーレ | 4 - 2 | FC岐阜 |
| 27 刈谷メイン | ＪＦＬ | FC刈谷 | 2 - 2 | ファジアーノ岡山 |
| 29 大井陸上 | 関東Ｌ２ | エリースFC東京 | 1 - 1 | 飯能ブルーダー |
| 29 飛田給メイン | Ｊ１ | FC東京 | 1 - 0 | 大分トリニータ |
| 04 大三島多々羅 | 四国Ｌ | 愛媛しまなみ | 0 - 6 | カマタマーレ讃岐 |
| 06 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | サガン鳥栖 |
| 11 熊本ＫＫウィング | Ｊ２ | ロアッソ熊本 | 0 - 2 | FC岐阜 |
| 18 岩手県営ラグビー | 天皇杯予選 | 盛岡中央高校 | 3 - 0 | 南部クラブ |
| 18 岩手県営陸上 | 東北Ｌ１ | グルージャ盛岡 | 4 - 0 | 仙台中田 |
| 18 岩手県営サッカー | 天皇杯予選 | 平泉クラブ | 3 - 1 | IWATE TODOS |
| 24 湖南 | ＪＦＬ | MIOびわこ草津 | 2 - 0 | 三菱水島 |
| 25 高松成合Ｂ | 全社予選 | 高商クラブ | 2 - 1 | 四電FC |
| 25 鳴門陸 | Ｊ２ | 徳島ヴォルティス | 0 - 4 | サガン鳥栖 |
| 01 敦賀 | 北信越Ｌ１ | サウルコス福井 | 3 - 3 | ヴァリエンテ富山 |
| 07 百花台 | 九州Ｌ | ヴァンクール熊本 | 0 - 7 | Ｖファーレン長崎 |
| 07 国見町 | 九州Ｌ | 新日鐵大分 | 0 - 1 | ホンダロック |
| 08 みなとみらい | 関東Ｌ１ | YSCC | 4 - 1 | さいたまSC |
| 11 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 0 | ロアッソ熊本 |
| 22 金沢市民 | 北信越Ｌ１ | フェルヴォローザ石川白山 | 0 - 2 | ツエーゲン金沢 |
| 25 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | アビスパ福岡 |
| 29 中京大・新 | 東海Ｌ１ | 中京大学FC | 2 - 0 | 佐川急便中京 |
| 29 中京大・新 | 東海Ｌ１ | コニカミノルタSC豊川 | 1 - 5 | 静岡FC |
| 05 鈴鹿メイン | 全社予選 | 伊勢ペルソナ | 2 - 0 | 静岡スバル自動車 |
| 05 神戸中央／WING | Ｊ１ | ヴィッセル神戸 | 1 - 0 | 大宮アルディージャ |
| 06 和歌山せせらぎ | 天皇杯予選 | ラバーズ45 | 1 - 4 | 近畿大理工学部 |
| 06 阪南大 | 関西Ｌ１ | FC京都BAMB | 1 - 10 | 阪南大クラブ |
| 06 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 2 - 1 | モンテディオ山形 |
| 12 若松会津 | 天皇杯予選 | パナソニック福島 | 延 1 - 0 | オリンパス会津 |
| 13 五戸高 | 天皇杯予選 | 北里大獣医畜産学部 | 3 - 6 | 海上自衛隊八戸 |
| 19 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 0 | 湘南ベルマーレ |
| 29 国立 | KirinC.Cup | Japan National U-23 | 0 - 1 | Argentina National U-23 |
| 01 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | 水戸ホーリーホック |
| 03 釧路市民サブ | 北海道Ｌ | Ｒシュペルブ釧路 | 6 - 1 | SSSシェフィールド |
| 10 国分陸上 | 九州Ｌ | ヴォルカ鹿児島 | 1 - 1 pk | ホンダロック |
| 10 鳥栖 | Ｊ２ | サガン鳥栖 | 0 - 0 | FC岐阜 |
| 16 Daejeon_Sub | 韓国ＮＬ | Daejeon KHNP | 0 - 1 | Goyang Kookmin Bank |
| 16 Cheonan | 韓国ＮＬ | Cheonan City | 2 - 2 | Incheon Korail |
| 17 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 1 | 徳島ヴォルティス |
| 30 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | 愛媛FC |
| 06 岡山県営／桃太郎 | ＪＦＬ | ファジアーノ岡山 | 2 - 2 | ソニー仙台 |
| 07 吉田人工芝 | 中国Ｌ | 佐川急便中国 | 6 - 0 | 日立笠戸 |
| 07 吉田人工芝 | 中国Ｌ | マツダSC | 0 - 1 | 宇部ヤーマン |
| 07 広島ＢＡ | Ｊ２ | サンフレッチェ広島 | 7 - 1 | FC岐阜 |
| 14 長良川メドウ | 天皇杯 | FC岐阜セカンド | 0 - 1 | 阪南大学 |
| 15 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 6 | セレッソ大阪 |
| 21 港 | 天皇杯 | 阪南大学 | 0 - 4 | HondaFC |
| 27 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 1 | アビスパ福岡 |
| 28 小牧 | 東海Ｌ１ | 佐川急便中京 | 0 - 1 | 藤枝市役所 |
| 04 藤枝市民 | 東海Ｌ１ | 矢崎バレンテ | 1 - 1 | 静岡FC |
| 05 伊那市 | 北信越ＣＬ | M.A.C.SALTO | 3 - 4 | 福井KSC |
| 12 富山 | 天皇杯 | FC岐阜 | 1 - 0 | ツエーゲン金沢 |
| 18 新潟鳥屋野 | 全国社会人 | サウルコス福井 | 2 - 3 延 | 秋田カンビアーレ |
| 18 新潟ＢＳサブ | 全国社会人 | サンクくりやま | 1 - 9 | YSCC |
| 19 新発田中央 | 全国社会人 | クラブドラゴンズ | 0 - 4 | 長野パルセイロ |
| 19 ＳＩ聖籠 | 全国社会人 | 松本山雅 | 2 - 1 | tonan前橋 |
| 21 新潟白山 | 全国社会人 | ホンダロック | 0 - 4 | 長野パルセイロ |
| 21 新潟白山 | 全国社会人 | NECトーキン | 延 2 - 1 | 松本山雅 |
| 22 新潟ＢＳメイン | 全国社会人 | ホンダロック | 1 - 0 | 松本山雅 |
| 22 新潟ＢＳメイン | 全国社会人 | 長野パルセイロ | 2 - 1 | NECトーキン |
| 02 豊田Ｓメイン | 天皇杯 | 名古屋グランパス | 1 - 0 | FC岐阜 |
| 03 駒場メイン | 天皇杯 | 浦和レッズ | 延 1 - 0 | 愛媛FC |
| 09 高山中山 | 岐阜県Ｌ２ | 古川クラブ | 0 - 6 | FC岐阜セカンド |
| 09 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 0 - 1 | 横浜FC |
| 15 相模原麻溝 | 関東社会人 | 横浜GSコブラ | 0 - 2 | 日立ビルケア |
| 15 相模原麻溝 | 関東社会人 | 東京海上日動火災 | 1 - 1 pk | tonan前橋 |
| 24 鳥取バード | 地域／予選 | RENOFA YAMAGUCHI | pk 1 - 1 | 松本山雅 |
| 24 布勢陸上 | 地域／予選 | 町田ゼルビア | pk 1 - 1 | 矢崎バレンテ |
| 28 石垣赤馬 | 地域／決勝 | ホンダロック | 0 - 5 | Ｖファーレン長崎 |
| 28 石垣赤馬 | 地域／決勝 | RENOFA YAMAGUCHI | 0 - 2 | 町田ゼルビア |
| 29 石垣赤馬 | 地域／決勝 | ホンダロック | 2 - 0 | RENOFA YAMAGUCHI |
| 29 石垣赤馬 | 地域／決勝 | Ｖファーレン長崎 | 0 - 0 pk | 町田ゼルビア |
| 30 石垣赤馬 | 地域／決勝 | ホンダロック | 1 - 2 | 町田ゼルビア |
| 30 石垣赤馬 | 地域／決勝 | Ｖファーレン長崎 | 1 - 0 | RENOFA YAMAGUCHI |
| 06 長良川 | Ｊ２ | FC岐阜 | 1 - 0 | サガン鳥栖 |
| 18 Jeju | 韓国ＦＡ杯 | Gyeongnam FC | 5 - 0 | Goyang Kookmin Bank |
| 18 Jeju | 韓国ＦＡ杯 | Daegu FC | 0 - 2 | Pohang Steelers |