| 01 国立 | 天皇杯 | 浦和レッズ | 1 - 0 | ガンバ大阪 |
| 13 鈴鹿サブ４ | 東海社会人 | 養老クラブ | 2 - 3 | 藤枝ネルソン |
| 13 鈴鹿メイン | 東海社会人 | FCゴール | 0 - 4 | M.I.E.ランポーレ |
| 14 鈴鹿メイン | 東海社会人 | 藤枝ネルソン | 1 - 3 | トヨタ蹴球団 |
| 14 鈴鹿メイン | 東海社会人 | ヤマハ発動機 | 0 - 1 | M.I.E.ランポーレ |
| 21 糸満西崎 | 九州Ｌ入替 | 海邦銀行SC | 4 - 3 | 延岡市SC |
| 12 大井２球 | 天皇杯予選 | フエンテ東久留米 | 2 - 2 pk | 東京教員 |
| 12 大井２球 | 天皇杯予選 | 城北ランシールズ | 4 - 1 | アストラ倶楽部 |
| 21 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 2 - 0 | アルテ高崎 |
| 21 刈谷メイン | ＪＦＬ | FC刈谷 | 0 - 2 | 栃木SC |
| 25 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 1 - 0 | TDK |
| 01 町田小野路 | 天皇杯予選 | TFSC | 1 - 2 | エリースFC東京 |
| 08 大垣南公園 | 全社予選 | 養老クラブ | 1 - 2 | FC岐阜/B |
| 08 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 1 - 0 | 三菱水島 |
| 15 さいたま秋葉の森 | 関東Ｌ１ | 埼玉SC | 1 - 0 | TFSC |
| 15 しんよこFP | 関東Ｌ２ | 海自厚木マーカス | 1 - 2 | 与野蹴魂会 |
| 21 甲賀水口多目的 | 関西Ｌ２ | ルネス学園甲賀 | 1 - 1 | 京都紫光クラブ |
| 22 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 3 - 0 | 流通経済大学 |
| 28 熊谷陸上 | ＪＦＬ | アルテ高崎 | 0 - 1 | YKK AP |
| 29 足利 | ＪＦＬ | 栃木SC | 0 - 1 | FC岐阜 |
| 03 松本広域球技 | 全社予選 | 上田ジェンシャン | 3 - 0 | アンテロープ塩尻 |
| 03 松本ALWINサブ | 全社予選 | 松本山雅 | 7 - 0 | 茅野チェルシー |
| 04 鹿沼 | 関東Ｌ１ | 日立栃木UVA | 3 - 1 | 埼玉SC |
| 13 大垣浅中陸上 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 1 - 0 | FC琉球 |
| 19 万博大阪サッカー | 関西Ｌ２ | 阪南大クラブ | 1 - 1 | 高田FC |
| 20 韮崎市 | 関東Ｌ２ | 韮崎アストロス | 0 - 0 | 飯能ブルーダー |
| 03 各務原Phoenix | 東海Ｌ２ | モリシンズ | 0 - 3 | 名古屋クラブ |
| 16 皇子山 | ＪＦＬ | 佐川急便SC | 2 - 1 | FC岐阜 |
| 17 帯広馬事公苑 | 北海道Ｌ | とかちフェアスカイジェネシス | 3 - 0 | 北蹴会 |
| 23 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 4 - 2 | ガイナーレ鳥取 |
| 24 津海浜公園 | 東海Ｌ２ | マインドハウス四日市 | 1 - 1 | コニカミノルタSC豊川 |
| 29 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 0 - 1 | HondaFC |
| 30 東総 | ＪＦＬ | ジェフリザーブズ | 3 - 1 | ソニー仙台 |
| 01 南長野 | 北信越Ｌ１ | 長野パルセイロ | 0 - 3 | 松本山雅 |
| 06 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 0 - 0 | アローズ北陸 |
| 15 福井県営サッカー | 天皇杯予選 | サウルコス福井 | 4 - 0 | 丸岡高校 |
| 16 出雲浜山陸上 | 全社予選 | 元気SC | 0 - 3 | セントラル中国 |
| 21 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 0 - 2 | 栃木SC |
| 22 野洲川ＢＬ＿Ｃ | 関西Ｌ１ | FC Mi-OびわこKusatsu | 0 - 2 | バンディオンセ神戸 |
| 22 佐川守山 | ＪＦＬ | 佐川急便SC | 2 - 0 | ガイナーレ鳥取 |
| 03 長良川 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 1 - 1 | 横河武蔵野 |
| 15 磐田 | Ｊ１ | ジュビロ磐田 | 5 - 2 | FC東京 |
| 18 松本ALWINサブ | 全社予選 | ツエーゲン金沢 | 3 - 4 | Japanサッカーカレッジ |
| 01 弘前陸 | 天皇杯予選 | 八戸大学 | 2 - 1 | 光星学院高校 |
| 01 弘前陸 | 天皇杯予選 | 青森山田高校 | 2 - 0 | ヴァンラーレ八戸 |
| 09 新潟小新 | 北信越Ｌ２ | グランセナ新潟 | 2 - 0 | 丸岡フェニックス |
| 09 聖籠ＪＳＣ | 北信越Ｌ１ | Japanサッカーカレッジ | 2 - 2 | 松本山雅 |
| 16 長良川メドウ | 天皇杯 | FC岐阜 | 3 - 1 | 福岡教育大学 |
| 18 Busan | 韓国ＮＬ | Busan Transportation | 1 - 3 | Suwon City |
| 19 Seongnam | ＡＣＬ | Seongnam Ilhwa | 2 - 1 | Al Karama |
| 23 高岡SCメイン | 天皇杯 | アローズ北陸 | 2 - 0 | 佐川印刷 |
| 28 佐川守山 | ＪＦＬ | 佐川急便SC | 1 - 0 | 栃木SC |
| 29 瑞穂ラグビー | Ｊ１ | 名古屋グランパス | 2 - 0 | 柏レイソル |
| 30 日立 | Ｊ２ | 水戸ホーリーホック | 0 - 1 | ベガルタ仙台 |
| 07 口論義 | 東海Ｌ２ | 名古屋クラブ | 1 - 2 | M.I.E.ランポーレ |
| 13 大分ＳＰ／Ｂ | 全国社会人 | 松本山雅 | 3 - 0 | トヨタ自動車北海道 |
| 13 大分ＳＰ／協会 | 全国社会人 | カマタマーレ讃岐 | 延 1 - 0 | 佐川コンピュータシステム |
| 13 大分ＳＰ／協会 | 全国社会人 | 高田FC | 0 - 4 | ニューウェーブ北九州 |
| 14 別府実相寺 | 全国社会人 | アイン食品 | 4 - 0 | NECトーキン |
| 14 別府野口原 | 全国社会人 | ASラランジャ京都 | 2 - 1 | セントラル中国 |
| 15 大分津留 | 全国社会人 | FC Mi-OびわこKusatsu | 3 - 1 | ニューウェーブ北九州 |
| 15 大分津留 | 全国社会人 | アイン食品 | 0 - 0 pk | 矢崎バレンテ |
| 20 奈良産大 | 関西ＬＣ | 京都紫光クラブ | 2 - 3 | ASラランジャ京都 |
| 27 北九州本城運動 | 九州Ｌ | OSUMI NIFS Utd. | 2 - 3 | 三菱重工長崎 |
| 27 北九州本城陸上 | 九州Ｌ | ホンダロック | 3 - 1 | 新日鐵大分 |
| 03 大垣浅中陸上 | ＪＦＬ | FC岐阜 | 3 - 2 | ソニー仙台 |
| 04 浜松大 | 東海Ｌ２ | 静岡教員芙蓉クラブ | 6 - 1 | FC川崎 |
| 17 長良川メドウ | 高選手権予選 | 岐阜工業高校 | 2 - 0 | 各務原高校 |
| 23 刈谷メイン | 地域／予選 | 町田ゼルビア | 0 - 1 | バンディオンセ神戸 |
| 23 刈谷メイン | 地域／予選 | 静岡FC | 3 - 1 | ノルブリッツ北海道 |
| 24 刈谷メイン | 地域／予選 | 町田ゼルビア | pk 2 - 2 | 静岡FC |
| 24 刈谷メイン | 地域／予選 | バンディオンセ神戸 | 3 - 1 | ノルブリッツ北海道 |
| 25 松本ALWINメイン | 地域／予選 | セントラル中国 | 0 - 6 | 徳島ヴォルティス・アマ |
| 25 松本ALWINメイン | 地域／予選 | FC Mi-OびわこKusatsu | 2 - 0 | 松本山雅 |
| 01 熊谷陸上 | 地域／決勝 | ファジアーノ岡山 | 0 - 0 pk | バンディオンセ神戸 |
| 01 熊谷陸上 | 地域／決勝 | ニューウェーブ北九州 | 0 - 1 | FC Mi-OびわこKusatsu |
| 02 高崎浜川 | ＪＦＬ | アルテ高崎 | 0 - 2 | FC岐阜 |
| 09 岐阜掛洞 | 岐阜地区Ｌ | FC岐阜/B | 10 - 0 | SPミニッツ |
| 10 豊田Ｓメイン | ＣＷＣ | Sepahan | 1 - 3 | Urawa Reds |
| 12 国立 | ＣＷＣ | Etoile Sahel | 0 - 1 | Boca Juniors |
| 19 磐田ゆめりあ | インカレ予選 | 駒澤大学 | 1 - 3 | 東京学芸大学 |
| 19 磐田ゆめりあ | インカレ予選 | 静岡産業大学 | 1 - 1 | 新潟経営大学 |
| 21 東員町 | インカレ予選 | 桃山学院大学 | 4 - 1 | 東北学院大学 |
| 21 東員町 | インカレ予選 | 早稲田大学 | 3 - 0 | 静岡大学 |
| 23 埼玉2002メイン | 天皇杯 | 愛媛FC | 0 - 2 | 川崎フロンターレ |
| 29 袋井Ecopaメイン | 天皇杯 | ガンバ大阪 | 1 - 3 | サンフレッチェ広島 |