| 01 国立 | 天皇杯 | 浦和レッズ | 2 - 1 | 清水エスパルス |
| 14 藤枝総合陸上 | 東海社会人 | 伊賀FC_MEW | 2 - 3 | 藤枝ネルソン |
| 15 沖縄県総合Ａ | 九州各県 | 熊本教員蹴友団 | 1 - 2 | 七隈トンビーズ |
| 22 西京極補助 | 関西Ｌ入替 | 神戸FCシニアC | pk 2 - 2 | 交野FC |
| 04 国立 | Ｊ２ | 東京ヴェルディ1969 | 4 - 1 | 徳島ヴォルティス |
| 11 群馬敷島陸上 | Ｊ２ | ザスパ草津 | 0 - 4 | 柏レイソル |
| 25 ひたちなか陸上 | ＪＦＬ | 流通経済大学 | 3 - 0 | ソニー仙台 |
| 26 駒沢補助 | 天皇杯予選 | エリースFC東京 | 2 - 0 | 東京ベイFC |
| 26 駒沢２球 | 天皇杯予選 | 町田ゼルビア | 4 - 1 | RacingClub |
| 02 八百津蘇水 | 全社予選 | FC岐阜/B | 1 - 0 | テクノ渡辺 |
| 09 津幡 | 北信越Ｌ１ | ツエーゲン金沢 | 7 - 0 | 上田ジェンシャン |
| 15 大井川多目的Ｂ | 自治体予選 | 焼津市役所 | 2 - 1 | 吉田町役場 |
| 15 大井川サッカーＡ | 自治体予選 | 藤枝市役所 | 10 - 0 | 沼津市役所 |
| 16 各務原勤労者 | 全社予選 | FC岐阜/B | 12 - 1 | セラヴィ |
| 16 岐阜経済大 | 全社予選 | FC岐阜 | 4 - 0 | SPミニッツ |
| 23 福岡ＦＣ＿Ａ | 九州Ｌ | 七隈トンビーズ | 1 - 5 | OSUMI NIFS Utd. |
| 29 駒沢１球 | 自衛隊大会 | 海自厚木マーカス | 2 - 0 | 空自浜松基地 |
| 29 習志野秋津 | ＪＦＬ | ジェフクラブ | 1 - 3 | FC刈谷 |
| 30 佐世保 | 九州Ｌ | Ｖファーレン長崎 | 3 - 2 | 沖縄かりゆし |
| 03 小瀬陸上 | Ｊ１ | ヴァンフォーレ甲府 | 1 - 3 | FC東京 |
| 07 J-STEP | 東海Ｌ１ | 静岡FC | 1 - 1 | FC岐阜 |
| 14 南郷 | 東北Ｌ２北 | ヴァンラーレ八戸 | 2 - 0 | 北都銀行 |
| 21 ホンダＡＬ | 東海Ｌ２ | ホンダ鈴鹿 | 1 - 0 | 春日井クラブ |
| 28 大垣浅中陸上 | 東海Ｌ１ | FC岐阜 | 2 - 0 | 中京大FC |
| 03 洛西浄化Ｃ | 関西Ｌ１ | 京都紫光クラブ | 1 - 0 | バンディオンセ神戸 |
| 04 長良川 | 東海Ｌ１ | FC岐阜 | 3 - 0 | マルヤス工業 |
| 11 三国陸上 | 北信越Ｌ２ | 丸岡フェニックス | 0 - 1 | 富山新庄クラブ |
| 18 中津川 | 東海Ｌ２ | FC川崎 | 0 - 4 | モリシンズ |
| 24 大垣浅中陸上 | 東海Ｌ１ | FC岐阜 | 2 - 0 | 静岡FC |
| 25 浜田 | 中国Ｌ | セントラル中国 | 6 - 3 | 佐川急便中国 |
| 02 松本ALWINメイン | 北信越Ｌ１ | 松本山雅 | 2 - 1 | 長野エルザ |
| 09 金沢有松 | 北信越Ｌ１ | テイヘンズ | 0 - 4 | 松本山雅 |
| 09 金沢有松 | 北信越Ｌ１ | ツエーゲン金沢 | 3 - 3 | JAPANサッカーカレッジ |
| 16 クレハいわき勿来 | 天皇杯予選 | クレハ | 3 - 3 pk | FC E-STAR |
| 16 いわきＧＦ | 天皇杯予選 | 東日本国際大学 | 0 - 5 | 相馬SC |
| 17 八戸工大 | 天皇杯予選 | 八戸大学 | 9 - 0 | 七戸高校 |
| 29 夕張平和 | 北海道Ｌ | サンクくりやま | 0 - 1 | ベアフット北海道 |
| 30 旭川富沢 | 北海道Ｌ | ACSC | 1 - 2 | ベアフット北海道 |
| 06 佐賀鹿島 | 天皇杯予選 | 九州INAX | v 3 - 2 | 佐賀商業高校 |
| 06 春日 | 九州Ｌ | 七隈トンビーズ | 3 - 0 | 海邦銀行SC |
| 12 瑞穂陸上 | Ｊ１ | 名古屋グランパス | 5 - 1 | ヴァンフォーレ甲府 |
| 19 平塚馬入天然１ | 天皇杯予選 | 横浜Ｆマリノスユース | 2 - 3 | 海自厚木マーカス |
| 19 平塚馬入天然１ | 天皇杯予選 | 神奈川教員 | 1 - 6 | 東邦チタニウム |
| 20 熊谷補助 | 天皇杯予選 | 埼玉SC | 3 - 1 | 飯能ブルーダー |
| 20 熊谷補助 | 天皇杯予選 | 尚美学園大学 | 2 - 1 | ホンダルミノッソ狭山 |
| 27 福田公園サッカー | 天皇杯予選 | 新日本石油水島 | 1 - 4 | 作陽高校 |
| 03 野洲川ＢＬ＿Ｂ | 天皇杯予選 | 滋賀FC | 3 - 4 延 | びわこ成蹊スポーツ大 |
| 09 浜厚真野原Ａ | 北海道Ｌ | トヨタ自動車北海道 | 1 - 4 | とかちフェアスカイ |
| 09 仙台七北田 | Ｊ２ | ベガルタ仙台 | 2 - 0 | 柏レイソル |
| 10 矢板 | 関東Ｌ１ | 矢板SC | 1 - 4 | YSCC |
| 17 韮崎中央 | 天皇杯 | 韮崎アストロス | 3 - 2 | 山形大学 |
| 17 小瀬陸上 | Ｊ１ | ヴァンフォーレ甲府 | 3 - 2 | 大宮アルディージャ |
| 23 大和 | 天皇杯 | 神奈川大学 | 0 - 1 | FC岐阜 |
| 24 東温 | 四国Ｌ | ベンターナAC | 1 - 3 | 徳島ヴォルティス・アマ |
| 08 群馬敷島サカラグ | 天皇杯 | ザスパ草津 | 3 - 0 | FC岐阜 |
| 14 仁賀保 | 全国社会人 | ノルブリッツ北海道 | 1 - 1 pk | フェルヴォローザ石川白山 |
| 14 金浦ＴＤＫ／Ｂ | 全国社会人 | FC西宮/A | 0 - 4 | 全神栖SC |
| 14 金浦ＴＤＫ／Ａ | 全国社会人 | 町田ゼルビア | pk 2 - 2 | 神戸FC1970 |
| 15 西目 | 全国社会人 | 静岡FC | 2 - 1 | カマタマーレ讃岐 |
| 21 八代陸上 | ＪＦＬ | ロッソ熊本 | 0 - 1 | 栃木SC |
| 22 宮崎生目 | ＪＦＬ | ホンダロック | 2 - 1 | 佐川急便大阪 |
| 29 揚倉山北 | 中国Ｌ | 佐川急便中国 | 1 - 1 pk | ファジアーノ岡山 |
| 11 神戸中央／WING | Ｊ２ | ヴィッセル神戸 | 3 - 4 | 柏レイソル |
| 12 出雲浜山補助 | 中国各県 | ヤーマン宇部 | 3 - 1 | 松江RM友の会 |
| 12 出雲浜山球技 | 中国各県 | SC松江 | 3 - 2 | 新日本石油水島 |
| 25 春野球技 | 地域／予選 | 静岡FC | 3 - 4 | FC Mi-OびわこKusatsu |
| 25 春野球技 | 地域／予選 | FC岐阜 | 2 - 0 | カマタマーレ讃岐 |
| 26 春野球技 | 地域／予選 | FC岐阜 | 7 - 0 | FC Mi-OびわこKusatsu |
| 26 春野球技 | 地域／予選 | 静岡FC | 4 - 0 | カマタマーレ讃岐 |
| 02 大分ＳＰ／Ａ | 地域／決勝 | ファジアーノ岡山 | 0 - 2 | FC岐阜 |
| 02 大分ＳＰ／Ａ | 地域／決勝 | Ｖファーレン長崎 | 0 - 0 pk | TDK |
| 03 大分ＳＰ／Ａ | 地域／決勝 | ファジアーノ岡山 | 1 - 1 pk | TDK |
| 03 大分ＳＰ／Ａ | 地域／決勝 | Ｖファーレン長崎 | 1 - 2 | FC岐阜 |
| 17 都農 | ＪＦＬ入替 | ホンダロック | 0 - 4 | FC岐阜 |
| 23 長良川メドウ | ＪＦＬ入替 | FC岐阜 | 4 - 1 | ホンダロック |