| 26 大分津留 | 地域／決勝 | 横河電機 | 3 - 0 | YKK |
| 26 大分津留 | 地域／決勝 | 大分トリニティ | 0 - 1 | 日本電装 |
| 27 大分津留 | 地域／決勝 | 横河電機 | 0 - 2 | 大分トリニティ |
| 27 大分津留 | 地域／決勝 | YKK | 0 - 2 | 日本電装 |
| 28 大分津留 | 地域／決勝 | 横河電機 | 1 - 1 pk | 日本電装 |
| 28 大分津留 | 地域／決勝 | YKK | 1 - 2 | 大分トリニティ |
| 16 磐田 | ＪＬ | ジュビロ磐田 | 3 - 0 | アビスパ福岡 |
| 23 瑞穂陸上 | ＪＬ | 名古屋グランパス | 3 - 1 | アビスパ福岡 |
| 30 西京極陸上 | ＪＬ | 京都パープルサンガ | 0 - 2 | セレッソ大阪 |
| 21 仙台五輪 | ＪＦＬ | ブランメル仙台 | 3 - 2 | ヴィッセル神戸 |
| 28 大垣浅中陸上 | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 0 - 1 v | 鳥栖フューチャーズ |
| 05 町田野津田 | ＪＦＬ | コンサドーレ札幌 | 1 - 2 v | コスモ四日市 |
| 12 甲府緑が丘 | ＪＦＬ | ヴァンフォーレ甲府 | 0 - 3 | 大分トリニティ |
| 16 刈谷メイン | ＪＦＬ | 日本電装 | 2 - 2 pk | ブランメル仙台 |
| 19 四日市 | ＪＦＬ | コスモ四日市 | 0 - 2 | ヴォルティス徳島 |
| 26 刈谷メイン | ＪＦＬ | 日本電装 | 2 - 4 | 福島FC |
| 09 大垣浅中陸上 | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 0 - 2 | 富士通川崎 |
| 16 長良川メドウ | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 2 - 3 | モンテディオ山形 |
| 23 都田 | ＪＦＬ | 本田技研 | 1 - 0 | 東京ガス |
| 07 富山岩瀬メイン | 北信越Ｌ | YKK | 0 - 1 | アルビレオ新潟 |
| 14 長良川メドウ | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 1 - 4 | ヴィッセル神戸 |
| 27 天童陸上 | ＪＦＬＡＳ | Japan All Stars | 3 - 9 | World All Stars |
| 17 長良川 | ＪＬ | 名古屋グランパス | 6 - 1 | セレッソ大阪 |
| 18 長良川メドウ | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 0 - 2 | ヴォルティス徳島 |
| 25 古河 | 関東Ｌ | プリマハム土浦 | 5 - 5 | ホンダルミノッソ狭山 |
| 29 長良川 | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 1 - 2 | 大分トリニティ |
| 01 刈谷メイン | ＪＦＬ | 日本電装 | 4 - 1 | NTT関東 |
| 01 長良川 | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 1 - 4 | ブランメル仙台 |
| 08 港 | 天皇杯予選 | 日本電装 | 4 - 0 | ミノルタ |
| 15 神戸ユニバメイン | ＪＦＬ | ヴィッセル神戸 | 5 - 1 | コンサドーレ札幌 |
| 18 瑞穂ラグビー | ＡＣＷＣ | Nagoya Grampus Eight | 3 - 0 | Haiphong Police |
| 22 浜松遠州灘 | ＪＦＬ | 本田技研 | 4 - 1 | ヴィッセル神戸 |
| 26 刈谷メイン | ＪＦＬ | 日本電装 | 1 - 4 | モンテディオ山形 |
| 28 瑞穂陸上 | ＪＬ | 名古屋グランパス | 1 - 2 v | 柏レイソル |
| 29 東員町 | ＪＦＬ | コスモ四日市 | pk 3 - 3 | ブランメル仙台 |
| 03 長良川メドウ | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 1 - 4 | ヴァンフォーレ甲府 |
| 06 神戸ユニバメイン | ＪＦＬ | ヴィッセル神戸 | 1 - 0 | 東京ガス |
| 09 長良川 | ＡＣＷＣ | Nagoya Grampus Eight | 2 - 0 | South China |
| 12 江戸川 | ＪＦＬ | 東京ガス | 2 - 0 | ヴォルティス徳島 |
| 13 多治見 | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 0 - 5 | 本田技研 |
| 20 大垣浅中陸上 | ＪＦＬ | 西濃運輸 | 0 - 1 | 東京ガス |
| 26 博多森球技 | ＪＬ | アビスパ福岡 | 0 - 1 | セレッソ大阪 |
| 27 鳥栖 | ＪＦＬ | 鳥栖フューチャーズ | 6 - 2 | 西濃運輸 |
| 03 五戸ひばり野 | 天皇杯 | 五戸町役場 | 2 - 1 | 三洋電機東京 |
| 10 一宮光明寺 | 天皇杯 | デンソー | 3 - 1 | ブレイズ熊本 |
| 16 長居第２ | 天皇杯 | セレッソ大阪 | 3 - 1 | 東京ガス |
| 23 高槻青少年 | 全国社会人 | ACMブルックス | pk 2 - 2 | 体大蹴鞠団 |
| 23 高槻青少年 | 全国社会人 | 藤沢市役所 | 1 - 3 | アローズ北陸 |
| 23 高槻陸上 | 全国社会人 | エリースFC | 1 - 0 | トーキン |
| 23 鴨池 | 天皇杯 | ベルマーレ平塚 | 3 - 1 | コスモ四日市 |
| 26 瑞穂陸上 | 天皇杯 | 浦和レッズ | 3 - 0 | ベルマーレ平塚 |